Необходимо в ветке реестраHKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Cryptography\Calais\SmartCards
для соответствующего носителя (зависит от конкретной установки) поменять криптопровайдер на eToken Base Cryptographic Provider.
Варианты носителей где срабатывало:
eToken_JAVA_10_Default